FAQ
게시판 리스트
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Whole meta data의 taxonomic profiling 방법을 알려주세요. 조회 1211 1. Microbial Genomics Module | Databases | Taxonomic Analysis | Download Microbial Reference Database tool을 실행시켜 주십시오. 실행 화면을 살펴보시면, 연구자가 직접 항목을 선택하여 DB를 구축할 수 있고, 모든 컨텐츠가 포함되어 있는 DB도 다운로드 받으실 수 있습니다. 2. 이렇게 DB를 다운로드 받으셨으면, Microbial Genomics Module | Databases | Taxonomic Analysis | Create Taxonomic Profiling Index tool을 실행시켜 주십시오. 위에서 받은 서열을 input으로 넣으신 후, indexing 진행해주시면 됩니다. 3. 이렇게 DB indexing도 끝났으면, Microbial Genomics Module | Metagenomics | Taxonomic Analysis | Taxonomic Profiling tool을 실행시켜 주십시오. input에는 OTU clustering을 진행한 abundance table을 넣으시고, reference index에는 위에서 만든 index 파일을 넣으셔서 분석을 진행하시면 됩니다.
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CLC Genomics Workbench에 있는 miRbase organism이 human으로 되어있던데, mouse는 없나요? 조회 1062 일단 CLC Genomics Workbench에는 homo sapiens organism miRbase만 있는 것으로 확인되었습니다. 허나, 그 안에 mus musculus 관련 서열도 포함되어 있는 것을 확인하여 mouse 분석을 진행하실 때, 해당 miRbase로 진행하시면 됩니다.
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유료 플러그인의 trial을 사용하고 싶습니다. 조회 997 Workbench를 설치하지 않으신 상태라면 아래 링크를 통해 설치를 진행해주세요. >> Workbench 설치하기 Workbench에서 trial을 사용해보고 싶으시다면 아래 링크를 통해 trial 라이선스를 적용해주세요. >> trial 적용하기 1. 먼저 실행하고 계신 workbench를 종료하신 후, 아이콘을 우클릭하여 관리자 권한으로 실행해주세요. 2. Workbench의 우측 상단의 Plugins를 클릭합니다. 3. 상단의 "Download Plugins"를 클릭합니다. 4. 오른쪽 목록에서 원하시는 플러그인을 선택 후, Download and Install을 클릭하세요. 유료 플러그인마다 사용할 수 있는 trial 기간이 빨간 글씨로 안내되오니, 해당 사항 유의하셔서 사용 부탁드립니다. 5. 아래 항목을 모두 채워주시고 OK를 누릅니다. 6. Plugin 설치가 진행되는 것을 확인하실 수 있습니다. 7. Plugin 설치 후 Workbench를 재시작하시면 plugin이 정상적으로 적용됩니다.
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CLC Network License Manager 설치 시, Windows에서 포트를 열고 싶습니다. 조회 1087 CLC Main Workbench 및 Genomics Workbench의 network 버전을 이용하실 경우, CLC Network License Manager 프로그램이 필요합니다. 해당 프로그램과 타 컴퓨터 간 라이선스 인증을 위해서는 특정 포트가 열려있어야 합니다. CLC Network License Manager 에서 사용하는 기본값인 6200번 포트를 Windows에서 여는 방법에 대해 안내 드립니다. 1. 제어판 > 시스템 및 보안 > Windows Defender 방화벽으로 진입 2. 좌측의 "고급 설정" 클릭 3. 좌측의 인바운드 규칙 클릭 후 우측에서 새 규칙 클릭 4. 포트 선택 및 다음 클릭 5. TCP 선택 후, 기본값인 6200 입력 6. 연결 허용 선택 7. 세 항목 모두 선택 8. CLC Main Workbench의 network 버전일 경우, CLCMainWorkbench_Network로 이름을 설정하고 마침 클릭. 9. 인바운드 규칙으로 돌아와 해당 이름을 가진 규칙이 추가되었는지 확인
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보유하고 있는 서열의 ORF 식별 후, protein 서열로 translation 하는 방법을 알려주세요. 조회 895 Classical Sequence Analysis | Nucleotide Analysis | Find Open Reading Frames Tool의 output options을 모두 선택하여 실행시켜 주시면, input으로 넣었던 서열에 ORF가 추가 annotation된 것을 확인하실 수 있습니다. 그런 다음, ORF가 추가 annotation된 서열을 Classical Sequence Analysis | Nucleotide Analysis | Translation to Protein Tool의 인풋으로 넣으셔서 분석을 진행하시면, 해당 ORF 서열의 protein 서열을 얻으실 수 있습니다.
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