FAQ
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IPA Core analysis에서 중복된 유전자에 대한 표시 관련 질문입니다. 조회 1089 중복된 ID의 경우는 아래 core analysis 파라미터 설정하는 부분에서 Advanced 버튼을 누르면 중복 ID의 수치를 어떻게 처리할지를 설정할 수가 있습니다. 기본적으로 발현값 중에 maxium 값으로 적용이 되고 있습니다.
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Pathway Designer (Path Designer) 실행 시 다음과 같은 에러 창이 뜹니다. 조회 1265 위와 같은 에러가 뜰 경우, 먼저 현재 설치되어 있는 IPA를 삭제해주세요. 이후 https://analysis.ingenuity.com/pa/installer/select 에서 새로 인스톨러를 다운받으신 후 설치를 진행해주세요.
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관심있는 유전자가 포함되어 있는 pathway만 확인할 수 있는 방법은 없는지, 이 관련 유전자를 활성화/혹은 억제 시켰을때 다른 signal들이 어떻게 바뀌는지 확인하는 방법이 궁금합니다. 조회 1283 검색을 통하여 관심 유전자를 검색하여 유전자 이름을 클릭하면 Gene Detail view에서 관심 유전자가 포함된 pathway 정보가 확인이 되고 확인하고자 하는 pathway를 띄운 후, overlay 기능을 통해 MAP 를 사용하면 관심 유전자를 임의로 활성화/혹은 억제 시켰을 때 pathway 내의 molecule들이 어떻게 변화하는지 예측할 수 있습니다.
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Core analysis에서 Canonicial Pathways에 확인되지 않으나, 제가 궁금해 하는 molecule이나 pathway와 관련된 signal들이 어떻게 변화하였는지 확인하려면 어디에서 확인할 수 있나요? 조회 1005 관심있는 특정 pathway를 확인하고 싶으시면, 검색창에서 해당 pathway를 검색 하셔서 각각의 pathway를 열고, 업로드 하신 데이터셋을 overlay 기능을 통해 선택하신 pathway에 발현 정보를 입히실 수 있습니다.
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CLC Genomics Workbench에서 Local BLAST 수행하는 방법이 무엇인가요? 조회 928 아래 링크에 DB set up 및 BLAST 수행 방법에 대해 나와있으니, 참고 부탁드립니다. Local BLAST in CLC Genomics Workbench
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