FAQ
게시판 리스트
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CLC Genomics Workbench에서 table을 다운 받는 방법이 있을지요? 조회 1367 1. 왼쪽 상단에 Export 버튼을 누르시고, 내보내기할 때 원하시는 파일 포맷을 입력하여 선택합니다. (ex: Excel 2010) 2. 내보내기 할 파일을 선택 후, Next를 클릭합니다. 3-1. 모든 컬럼을 내보내기 하실 때는 Export all columns를 클릭합니다. 3-2. 선택 컬럼만 내보내기 하실 때는 Export all columns를 체크 해제하고 Next를 클릭합니다. Table에서 선택하신 column들만 체크가 되있을 것입니다. (혹은 이 창에서 원하는 column을 선택하셔도 됩니다) 4. 저장 위치를 선택하고 Finish를 클릭합니다.
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HGMD의 유전자 항목에 연결할 참조 cDNA를 어떻게 결정하나요? 조회 1314 일반적으로 해당 유전자에 대한 Refseq ID가 두 개 이상인 경우, HGMD 큐레이션 팀은 논문에 사용된 알맞는 데이터와 일치시키도록 시도하거나, 가장 긴 transcript 또는 가장 흔한 mRNA isoform을 사용합니다.
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Trim adapter list 만드는 방법을 알려주세요. 조회 1063 1. 상단 메뉴바에서 New -> Trim Adapter List를 클릭 2. 하단의 Add Row 버튼 클릭 3. forward, reverse 각각 1개씩 따로 만들어줘야됩니다. primer, adapter 서열을 Sequence 부분에 넣어준 후, 아래 그림과 같이 세팅해주세요. (workbench는 f / r 서열 모두 5` - 3` 방향으로 로드되나, 혹시 모르니 본인의 데이터를 검토한 후, 자르는 방향은 정해주시면 됩니다.) (예를 들어, single-end 데이터는 간혹 5`쪽에 f 프라이머, 3`쪽에 r 프라이머가 존재하는 경우가 있으니, 데이터를 잘 검토해주세요.) 4., 이렇게 f / r trimming 리스트를 다 만드신 다음, 아래 이미와 같이 모두 선택한다음 파일 저장해주시면 됩니다.
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Navigation Area에 데이터 아이콘이 느낌표로 나타나고, 데이터가 열리지 않습니다. 조회 952 Navigation Area에서 데이터의 아이콘이 느낌표 로 나타나는 것은 상위 버전의 Workbench에서 분석한 데이터이기 때문입니다. 해당 데이터를 더블클릭하여 열면 'Cannot Open' 이라는 창이 뜨며, 아래와 같은 문구를 보여줍니다. 'Cannot open this element. It seems to be created in a newer version or different type of Workbench or through a plugin that is not installed.' 해결을 위해서는 해당 데이터를 분석한 버전으로 업그레이드를 하거나 최신 버전으로 업그레이드를 하셔야 합니다.
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논문에서 HGMD Professional를 참조하고 싶습니다. 조회 1219 하단의 정보를 논문에 인용하세요. Stenson PD, Mort M, Ball EV, Evans K, Hayden M, Heywood S, Hussain M, Phillips AD, Cooper DN. The Human Gene Mutation Database: towards a comprehensive repository of inherited mutation data for medical research, genetic diagnosis and next-generation sequencing studies. Hum Genet 136:665-677, 2017. Pubmed 링크
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