FAQ
게시판 리스트
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Genomics Server 소프트웨어에 Command Line Tool을 설치 해야하나요? 조회 859 Command Line Tools는 Genomics Server의 Client 서버입니다. 필요사항은 Genomics Server가 설치된 컴퓨터가 계속 진행중이고 연결이 되어 있어야합니다.
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CLC job에서 grid node로 보내는 CPU 수를 줄이는 방법은 무엇인가요? 조회 850 사용된 그리드 시스템에 따라서 달라집니다. 1) 병렬환경을 사용하지 않을 때 CPU 코어 사용량 제한 방법 기본적으로 CLC Server는 그리드 작업에 할당된 슬롯 수를 무시하고 실행 호스트의 모든 코어를 이용합니다. 즉, 작업이 실행 호스트의 모든 코어에서 실행됩니다. 만약 1로 지정되어있을 경우 할당되는 슬롯의 개수가의 최대 코어 수로 해석되어 진행됩니다. 그리드 사전 설정의 기본사양에 다음을 추가: -v CLC_USE_OGE_SLOTS_AS_CORES=1 (이용 코어 수는 작업 OGE로 할당된 슬롯수와 같습니다.)2) 병렬환경을 사용할 때 CPU 코어 사용량 제한 방법 그리드 시스템을 작업하는 병렬환경기능에 의하여 코어수를 제한하는 경우 기본 사양 구문은 다음과 같습니다. -pe $PE_NAME $MIN_CORE-$MAX_CORE (병렬환경기능 사용시 코어수는 할당된 슬롯 수로 계산됩니다. 즉 이용코어수는 슬롯수와 동일) -l cfl=1 -l qname=32bit -pe clc 1-3. 와 같은 경우 병렬환경 설정이 되고, 1내지 3개의 코어수가 요구됩니다.
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SERVER는 Single이나 Master로 지정되어야 하나요? 조회 783 Admin tab에서 Server Mode를 설정할 수 있으며, 모드에 따라서 Server가 job을 직접적으로 할당 할수 있는 여부가 달라지기 때문에 지정해야 합니다. 만약 Master Mode라면 Genomics Server가 그자체로 job을 바로 진행하지 못하고 grid system으로 던진 이후 진행이됩니다. 반면 Single Server라면 바로 job을 받을 수 있습니다.
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CLC Server grid 셋업하는 job engines은 무엇인가요? 조회 878 CLC Server는 master server를 통하여 grid node로 전송할 수 있고, grid scheduling system을 통하여 작업을 스케쥴링하고 진행하도록 배정합니다. CLC에서는 공식적으로 세개의 플랫폼을 사용합니다.(OGE , PBS Pro 와 IBM Platform LSF)
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Attach Node 버튼이 비활성화 되어있는 이유는 무엇인가요? 조회 781 CLC Server의 CLC Job Node를 이용하려면 "Server mode"에서 MASTER Node로 지정을 해야합니다.
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