FAQ
게시판 리스트
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PetaSuite는 시퀀서 차이에 의한 압축 효율의 차이가 있나요? 조회 1448 현재 Illumina와 Ion Torrent 기반의 데이터셋에 대한 압축은 최적화되어 있습니다. 다른 시퀀서들도 Fastq.gz 및 bam 포맷과 비교하면 확연히 뛰어난 압축률을 보여주고는 있으나, 최적화 상태까지는 아니기 때문에 현재 최적화를 위한 개발중에 있습니다.
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QCI Interpret One의 case report 정보가 궁금합니다. 조회 1359 1. 변이 리스트에 Summary 정보. Overall comment Tier 1 관련 변이 ( 허가받은 Therapies 정보, Resistant therapies 정보, clinical trials) Tier 2 관련 변이 변이의 biological significance Guideline 정보 Report Contents 2. Guideline, Interactions, Therapy option 정보. Guideline - 바이오 마커와 관련, 질병 관련 Interactions - Clinical study 문헌을 통한 변이와 임상 정보 관련성 확인 Therapy options - Drug label 정보, Clinical trials 정보, Sensitive & resistance therapies 정보
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QCI Interpret vs QCI Interpret One 차이는 무엇인가요? 조회 1385 QCI Interpret 과 QCI Interpt One의 차이는 무엇인가요? 아래 그림과 같이 QCI Interpret One은 Oncology variant interpretation의 최적화된 데이터베이스입니다. - Oncologist 및 전문가(PhD)의 리뷰과정을 거친 변이 정보 업데이트 - 상세한 molecular function 및 clinical relevance 정보, 질병 관련 변이 정보와 더불어 해석 정보 포함
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PetaSuite에서 압축 결과물로 입력 파일을 하나로 병합할 수 있나요? 조회 1384 PetaSuite를 이용하여 압축 결과를 하나의 파일로 병합할 경우, fastq.gz 파일을 하나로 붙인 것과 동일한 결과를 가집니다.
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PetaSuite는 원본 FASTQ/BAM 파일과 비교하여 압축 파일의 유효성을 검사하나요? 조회 1438 처음 백만 개 read에 대한 빠른 유효성 검사가 기본적으로 활성화되어 있습니다. 해당 옵션을 변경하여 전체 read에 대한 유효성 검사를 진행할 수도 있습니다. 또한 MD5 checksum을 직접 확인하도록 선택할 수도 있습니다. 기본의 파일들에 대한 MD5 checksum을 확인하신 후, 압축 시 도출되는 값과 비교하실 수 있습니다.
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