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[뉴스레터] QIAGEN 9월 웨비나 - 데이터에서 새로운 발견에 이르기까지 조회 1119 아시아-태평양, 디스커버리 앤 리서치 데이 - 데이터에서 새로운 발견에 이르기까지 수천 명의 과학자들이 왜 QIAGEN 디지털 통찰력 솔루션을 선택하여 ‘오믹스 데이터’에서 생물학적 의미를 처리하고 밝혀내는지 확인합니다. 이 웨비나는 다음과 같은 주제로 진행됩니다. 어떠한 시퀀싱 플랫폼으로부터의 RNA-seq 데이터이던지 쉽고 사용자 친화적인 2차 분석 및 해석 대규모 처리된 데이터 세트 및 독립 연구에서 분석된 데이터를 기반으로 가설을 생성하여 연구를 진전시키는 능력 미생물 및 바이러스 게놈을 위한 최신 소프트웨어 - Metagenomics, typing, coronavirus 디스커버리 앤 리서치 데이에 하루 1시간을 투자하고 얼만큼 생물학적 이해를 향상시킬 수 있는지 확인해보세요. 웨비나 일정은 다음과 같습니다. 2020. 09. 08 (화) 데이터에서 발견까지 - 쉽고 빠른 RNA-seq 분석 및 해석의 라이브 데모 2020. 09. 09 (수) 발견부터 인사이트까지 - 대규모 데이터 세트와 독립 연구 결과를 활용한 연구의 진전 2020. 09. 10 (목) 미생물 유전체학 – Metagenomics, typing, coronavirus 의 연구 지금 등록하세요! (Ctrl을 누른 상태로 클릭해주세요!) 행사 상세 날짜 : 2020. 09. 08 ~ 2020. 09. 10 장소 : 온라인 시간 : 싱가포르 시간대 오후 2시 (한국 오후 3시)

[뉴스레터] QIAGEN 9월 웨비나 - 종양학 및 유전병 변이에 대하여 (reads부터 report까지) 조회 1306 아시아-태평양, 종양학 및 유전병 변이에 대한 웨비나 – reads부터 report까지 전 세계의 실험실에서 routine testing의 분석 및 해석을 위해 QIAGEN 솔루션을 선택하는 이유를 확인해보세요. 이러한 것들을 찾고 있는 분들에게 도움이 될 거에요. FastQ부터 Report까지의 워크플로우 표준화 효율적이고 사용자 친화적인 이차 분석 전문적인 지침에 따라 포괄적인 변형 해석 및 보고 이틀간 하루 1시간을 투자하고 routine testing를 개선하기 위해 한 걸음 더 나아갈 수 있는 방법을 찾아보세요. 웨비나 일정은 다음과 같습니다. 2020. 09. 15 (화) 체세포성 암 : 체세포성 문제의 분석과 해석을 위한 보다 효과적이고 효율적인 routine testing - a live case study 2020. 09. 16 (수) 유전병과 암 : 보다 효과적이고 효율적인 routine 엑손 및 생식세포계열 패널 testing 분석 및 해석 - a live case study 여러분이 어떤 연구를 하고 있는지 아닌지 간에, QIAGEN사에서는 여러분의 데이터 분석과 해석의 고통을 치료할 수 있는 해결책을 가지고 있습니다. 지금 등록하세요! (CTRL을 누른 상태로 클릭해주세요!) 웨비나 상세 날짜 : 2020. 09. 15(화) ~ 2020. 09. 16(수) 장소 : 온라인 시간 : 싱가포르 시간대 오후 2시 (한국 오후 3시)

[뉴스레터] Get all human gene mutations in one click 조회 1120 HGMD Professional은 유례없이 종합적이고 최신입니다. 무료로 체험해보세요! HGMD Professional은 믿을 수 있는 데이터로 더 많은 사례를 빠르게 해결합니다. 현재 연구자들은 Human Gene Mutation Database (HGMD)에서 전문적으로 큐레이트 된 콘텐츠를 이용 가능하다는 것을 알고 있을 것입니다. HGMD의 Public 버전에 대한 무료 계정을 통해 연구자들은 인간의 유전병과 밀접하게 관련되거나 강조되는 생식계통 돌연변이의 포괄적인 컬렉션에 접근할 수 있습니다. 하지만 HGMD의 Public 버전을 사용함으로써 연구자들은 많은 콘텐츠를 놓치고 있습니다. HGMD의 Public 버전은 공개된 돌연변이 항목의 측면에서 3년 전 데이터베이스일 뿐만 아니라 임상적으로 중요한 연관성을 설명하는 데 중요한 수많은 검색 기능이 부족합니다. 오직 HGMD Professional에서만 할 수 있는 것이 있습니다. 밝혀진 희귀하고 새로운 유전적 돌연변이에 대한 최신 과학적 증거에 접근 염색체 위치, 유전자 온톨로지 및 표현형에 의한 탐색 새로운 돌연변이를 알려진 또는 예측된 규제 사이트에 매핑하여 보유하고 있는 데이터의 변이에서 유전자 조절 변화 이해 시간 절약 효율을 위한 배치 및 고급 검색 수행 질병 유전자, 약물 표적, 그리고 보유하고 있는 데이터의 변이와 관련된 경로 탐색 HGMD Public vs. HGMD Pro의 전체 비교는 이곳에서 볼 수 있습니다. HGMD PRO trial 버전을 요청하시길 원하시면 하단의 링크를 통해 신청해주시면 감사하겠습니다. 링크

[릴리즈] What’s new in the QIAGEN IPA Spring 2020 Release 조회 970 새로운 점 : Activity plot과 추가 사항 바이오 마커 발견, 약물 용도 변경, 생물학적 메커니즘 설명 등을 돕는 산점도(scatter plot)를 사용하여 IPA에서 OmicSoft 분석(> 60,000개)을 통해 특정 실체 (upstream regulator, canonical pathway 등)의 활동을 탐색하여 발견합니다. Analysis Match 라이선스가 필요합니다. Analysis Match 데이터베이스에 있는 6만 개 이상의 분석을 통한 상피간엽이행(EMT) 기능의 활성 예측 EMT는 3,500여개 이상의 분석 (각 분석은 plot의 점으로 표시되며, 제목에서 나타남)에서 특이적입니다. 이 부분집합에 대해 [SF-C1]을 선택하고 비교 유형인 "실험군 vs 대조군" 에 대해 추가적으로 필터링한 결과는 EMT에서 강한 억제(z-score < -2)를 나타냅니다. (이미지 상의 연두색 점) 융합 유전자를 네트워크나 경로 상에서 시각화하세요. 암 작동원리를 네트워크와 경로에서 융합 유전자의 시각화로 설명하세요. 비어있는 경로에서 BCR-ABL1 융합 유전자를 추가하여 생성된 작은 네트워크 다른 분자, 경로 및 질병들의 부분집합들은 융합 유전자의 상위 및 하위의 네트워크에 확장되어 추가되고, Molecule Activity Predictor tool을 사용하여 imatinib 약물을 시스템에 첨가하는 것을 시뮬레이션 하였습니다. "표준" 유전자에 사용 된 것과 동일한 유형의 관계가 융합 유전자에 사용됩니다. QIAGEN Land Explorer의 통합으로 방대한 오믹스 데이터를 탐색하세요 IPA에서 Land Explorer 전체로의 링크를 통해 생물학적 맥락에 대한 오믹스 데이터의 거대한 데이터베이스를 살펴보세요. Land Explorer 라이센스가 필요하지만, 2020 년 3월 29일부터 30일 동안 무료로 제공되는 Land Explorer trial에 자동 등록됩니다. QIAGEN Land Explorer가 QIAGEN IPA에 통합됩니다. 이러한 확장은 전반적인 오믹스 데이터에 대한 개별 유전자의 심층적인 탐구, 유전자 간 발현 상관관계, Analysis Match 데이터셋의 expression details 시각화를 가능하게 합니다. 컨텐츠 향상과 업데이트 6만 개 이상의 Analysis Match 데이터셋 약 139,000개의 새로운 발견, 총합 >7백만 개 이상 확장된 Canonical Pathways 5개의 새로운 경로 10개의 기존 경로가 이제 활성화 패턴을 가짐

[릴리즈] HGMD 2019.3 Release 조회 2004 HGMD Professional 2019.3 Release 더 많은 돌연변이, 더 향상된 annotations 2019년 가을 인간 유전자 돌연변이 데이터베이스 (HGMD) professional이 출시되었고, 세계에서 가장 많은 수의 인간 유전형 돌연변이를 이전 버전보다 6,278건 더 많은 269,000건 이상의 항목으로 확대하였습니다. HGMD Professional은 인간 유전병의 근간이거나 밀접한 관련이 있는 핵 유전자에서 공개된 생식세포 돌연변이를 포괄적으로 다루기 위한 사실상의 표준 리소스입니다. 1996년 Cardiff University의 의학 유전학 연구소에 의해 설립 및 유지 보수된 HGMD professional은 검출된 유전자 병변의 novelty와 병리학적 진위성을 뒷받침하기 위한 증거 및 특정 유전자 돌연변이 스펙트럼의 전체적인 개요 획득뿐만 아니라 whole genome screening 프로젝트, 생물정보학에서 사용하기 위한 지식 기반으로도 이용할 수 있는 특별한 리소스를 유저에게 제공합니다. 전문가에 의해 선별된 contents의 분기별 업데이트 매년 발간되는 질병 관련 생식 세포 돌연변이의 수는 지난 10 년 동안 두 배 이상 증가했습니다. 희귀하고 새로운 유전적 돌연변이가 계속 밝혀지고 있기 때문에, 최근 과학적 증거를 이용하는 것은 NGS data를 적시에 해석하는데 매우 중요합니다. HGMD professional은 임상연구소가 최신의 신뢰할 수 있는 정보로 NGS data를 분석하고 annotation할 수 있게 도와줍니다. HGMD 돌연변이는 다른 돌연변이 데이터베이스와 달리, 임상적 영향의 증거가 있는 peer-reviewed 출판물에 의해 모두 뒷받침됩니다. 돌연변이 항목은 일관성과 정확성을 위해 손수 선별되어 평가가 됩니다. 돌연변이 보고서에는 투명성을 위해 원본에 대한 링크가 포함되어 있습니다. 14,500개 이상의 출판물이 HGMD를 인용합니다. HGMD Professional 구독을 최대한 활용하려면 당사의 리소스 웹 페이지에서 사례 연구, 기술 노트 및 영상 튜토리얼을 확인하시면 됩니다. 또는 HGMD가 정밀 의학을 위한 유전학자 세대에게 어떻게 힘을 실어주었는지에 대해 on-demand webinar에서 HGMD의 매니저인 Peter Stenson으로부터 들어보시면 됩니다. ANNOVAR 새로운 ANNOVAR 데이터베이스 또한 사용할 수 있습니다. 일부 큰(>100GB) 파일을 제외하고 모든 ANNOVAR 데이터베이스는 AWS S3로 전송됩니다. 변이 annotation을 위한 ANNOVAR를 HGMD와 함께 사용하는 방법에 대해 이 링크를 통해 자세히 알아보십시오. 또한 ANNOVAR에 대한 webinar를 이 링크를 통해 시청해보세요. Genome Trax™ Genome Trax 업데이트는 2019년 10월 말에 제공될 예정이며, 업데이트 된 트랙은 HGMD 2019.3과 함께 release 되었습니다. 추가 주요 업데이트에는 TRANSFAC® release 2019.3 및 PROETOME ™ release 2019.3이 포함됩니다. 변이 해석을 위해 ACMG 분류가 필요하십니까? 생식세포 또는 체세포성 NGS testing에 대한 임상의 급의 보고서를 생성하고자 하는 실험실의 경우, HGMD professional을 포함한 40개의 공공 및 독점 데이터베이스로 구성된 QIAGEN Knowledge Base로부터 최신의 임상 증거를 사용하여 매우 복잡한 NGS 데이터를 표준화된 보고서로 재현 가능하게 변환해주는 QIAGEN Clinical Insight (QCI) Interpret을 활용하여 보고서를 생성할 수 있습니다. 다가오는 이벤트 American Society of Human Genetics (ASHG) Annual Meeting – October 15-19, 2019 | Houston, Texas Association for Molecular Pathology (AMP) Annual Meeting – November 7-9, 2019 | Baltimore, Maryland Genomic Medicine Nordic 2019 – November 13-14, 2019 | Copenhagen, Denmark

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