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[릴리즈] BIOBAM Blast2GO : Major Release Version 5.0 조회 1831 PAG Plant & Animal Genome Conference에 맞추어 Blast2GO 5를 출시했습니다! 이 새 버전에서는 새로운 기능들이 추가 되었습니다.무엇보다 가장 중요한 것은, 다양한 분석 단계에서 빠른 속도로 분석 할 수 있도록 도와주는 Blast2GO가 BioBam Cloud나 AWS 아키텍쳐가 Blast2GO와 연동된다는 점 입니다. 자세한 정보는 아래를 참조하시기 바랍니다.버전 4에서 5로 업그레이드하려면, 여기에서 최신 버전을 다운로드해야합니다.마이너 업데이트들은 자동으로 수행됩니다.피드백이나 문의사항이 있으시면 consulting@insilicogen.com로 연락 주시기 바랍니다.버전 5의 주요 기능 업그레이드 내용 :InterProScan을 cloud로 분석 (CloudIPS)Workflow (생성, 보기, 실행)De-Novo Transcript 발현 값 분석 (Fasta + FastQ)Blast Result Alignment 뷰어고성능 GFF 파일 뷰어"RNA-Seq" 및 "Gene Finding" 결과의 PDF 레포트새로운 Gene Ontology ID-매핑 전략 (더 빠르고 더 완벽하게, 독립적인 "gi")많은 결과를 보여주기 위한 새로운 디자인"Find Similar Sequences” 성능 향상Species taxonomy 분석 속도 개선Preferences : 메모리 및 임시 파일 설정 정의Preferences : Gene Ontology 버전 선택 : 최신버전 혹은 월별로 선택 가능"클라우드 사용" 모니터링의 개선
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[릴리즈] geneXplain platform과 TRANSFAC(R), HumanPSD™,TRANSPATH(R) 데이터베이스 조회 1355 새로운 기능이 추가되었습니다! 새해를 맞이하여 geneXplain 플랫폼과 TRANSFAC® 및 HumanPSD ™ + TRANSPATH® (PROTEOME ™) 데이터베이스가 업데이트 되었습니다. 계정에 로그인하여 최신 기능을 이용해 보세요.geneXplain 플랫폼 릴리즈 4.8geneXplain 플랫폼은 광범위한 생물정보학, 시스템 생물학에 적용하기 쉬운 온라인 툴박스로 워크플로우 관리 시스템입니다. geneXplain 플랫폼에 새롭게 추가된 기능들은 다음과 같습니다. - 새로운 사이트 분석 및 통계 방법 - 사이트 검색 및 HTML 리포트 기능 - 개선된 사용자 인터페이스 뷰 - 업데이트 된 TRANSFAC®와 TRANSPATH® 및 HumanPSD ™ 데이터베이스의 통합 새롭게 업데이트된 geneXplain 플랫폼 4.8의 자세한 설명은 다음 링크를 통해 볼 수 있습니다. >> geneXplain 플랫폼 릴리즈 4.8 TRANSFAC® 릴리즈 (2018년 1월)TRANSFAC®은 전사인자, 그리고 유전적 Binding Site와 DNA 결합 모티프(PWMs)에 대한 데이터베이스입니다.TRANSFAC® 데이터베이스의 새 버전에는 다음 기능들이 업데이트되었습니다. - 38개 포유류 종에 대한 전사 인자 범위 증가 - 마우스와 ENCODE로부터의 휴먼 ChIP-Seq 실험 정보를 통합 - JASPAR 2018 매트릭스 라이브러리 통합 - Ensembl release 90 까지 업데이트 완료 업데이트된 TRANSFAC® 데이터베이스를 더 자세히 보기 위해 아래 링크를 클릭하세요. >> TRANSFAC® 자세히 보기 HumanPSD ™ + TRANSPATH® 릴리즈 (2018년 1월)Human Proteome Survey 데이터베이스 (HumanPSD ™)는 질병관련 바이오마커와 약물 타겟인 휴먼 단백질을 중점적으로 다룹니다. HumanPSD ™ 데이터베이스의 새 버전에는 다음 기능이 추가되었습니다. - 질병 보고서를 기반으로 바이오마커 검색 - 질병 관련 임상 시험 조건의 다양성 증가 포유류 신호 전환 및 물질 대사 경로의 TRANSPATH® 데이터베이스에는 다음과 같은 새로운 기능이 추가되었습니다. - 다양한 유형의 암 발생에 관여하는 패스웨이는 이제 signal transduction pathways의 개요 페이지에 자세히 나와있습니다. 업데이트 된 TRANSPATH® 및 HumanPSD ™ 데이터베이스 릴리즈 (2018년 1월)에 대한 자세한 설명은 아래 링크를 통해 보실 수 있습니다.>> TRANSPATH® 및 HumanPSD ™ 자세히 보기 출시 예정효소, 또는 효소 리간드에 대한 정보를 담고 있는 BRENDA 데이터베이스가 곧 출시 될 예정이니 많은 관심을 바랍니다. 비디오 튜토리얼geneXplain platform 인트로 비디오>> 비디오 보기TRANSFAC 데이터베이스 인트로 비디오>> 비디오 보기MATCH 알고리즘 인트로 비디오>> 비디오 보기
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[뉴스레터] LabCollector version 5.3 출시 (업그레이드 안내) 조회 1056 LabCollector의 많은 중요한 기능이 업데이트 되었습니다.Import / Export 기능 : * 새 기능 : - Import Data 기능이 더 쉽게 진행될 수 있도록 재디자인(더 알아보기) - Equipment 모듈 : maintenance export 가능(일반/장비) 및 Maintenance로 필터 가능 - 화학구조의 SDF 파일 포맷 export와 fasta, plasmid와 sequence들의 gb파일 export 가능 * 기능 향상 : - 쉬운 인터페이스와 함께 저장 importer * 추가 : - 저장 브라우저에서 격자 형태의 저장 데이터 export 가능 - '시간'과 '유저리스트' 타입의 새로운 커스텀 필드 - 접미에 커스텀필드 추가하여 value값 뒤에 text가 항상 보일 수 있도록 함. - 이메일 알람 기능에서 통계적인 값에 옵션을 추가하기 위해 10진수의 커스텀 field 추가접근 가능 기능 : * 새 기능 : - 그룹 정책이 adds on에서도 특정 그룹이 block 되도록 설정 가능 * 변경 : - master 관리자가 새로운 lab members를 추가 할 수 있도록 함(user 계정 뿐 아니라) * 추가 : - 보안 그룹을 프로젝트 코드와 연결 - IP로부터 로그인 규율을 제한 Reagents & Supplies (시약&공급) : * 추가 : - 모듈에 이제 위험 탭에 대한 사용자 정의 필드가 있습니다. - 시약 및 소모품 모듈의 위험 탭 필드를 시약 및 소모품 내보내기 / 인쇄 가능 - Reagents & Supplies 모듈의 Risks 탭 필드를 이제 필터로 사용 가능 - Chemical lots : 이제 파일 / 보고서를 업로드하고 특정 로트와 연관 가능 - Chemical lots를 파괴 할 수있는 옵션 (데스트락 허가를 받은 사용자만 로트를 파괴 가능)기타 : * 기능 향상 : - 플라스미드 맵 에디터 - 프린트 할 때 자바 필요 없음 * 새 기능 : - 많은 아이콘과 커스텀 모듈 관리의 추가 옵션 - 새로운 웹서비스 API - 워크플로우 Add-on이 활성 워크플로우에 탭 추가
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[릴리즈] 유전형.표현형 정보 통합분석 솔루션, IncoGWAS 조회 1421 2017년 6월 유전형.표현형 정보 통합분석 솔루션, incoGWAS가 릴리즈 되었습니다.아래 사이트를 통해 incoGWAS를 사용해보세요!https://incogwas.net
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[뉴스레터] Ingenuity Variant Analysis Summer release 조회 1129 Introducing the IVA Summer ReleaseQIAGEN은 아래와 같이 IVA의 새로운 기능을 릴리즈하였습니다.가장 주목할만한 것은 gnomAD 데이터셋이 사용가능 하다는 것입니다. 많이 사용되고 있는 ExAC 데이터셋을 기반으로, gnomAD에는 ExAC보다 120k 더 많은 exome과 15k 더 많은 genome을 포함합니다.새로운 유대민족의 frequency도 필터링에 사용가능 합니다.My Filters는 필터링 단계와 전략을 공유하고 다른 IVA 및 QCI 사용자와 공유할 수 있게 해주는 새로운 기능입니다.원인 변이를 필터링하고 우선순위를 지정하기 위해 HPO term을 직접 업로드합니다.새로운 릴리즈에 대한 자세한 내용은 QIAGEN의 웹사이트를 방문하여 확인해보세요! [여기를 클릭해주세요!]
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