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[뉴스레터] QIAGEN,Check out the latest news and summer releases! 조회 1198 논란의 여지가 있는 생명의학 preprint를 캐내거나, 연구 소프트웨어에서 보다 견고해지는 방법을 모색하거나, 생물학과 의학에서 빅데이터 작업을 가능케 하려고 시도하는 PLoS Computational Biology의 간단한 규칙들을 살펴보십시오. Latest newsPLoS의 10가지 간단한 규칙 PLoS Computational Biology의 “10가지 간단한 규칙” 가이드는 한동안 사용되어 오면서 광범위한 생물정보학 주제에 훌륭한 리소스인 것을 알게 되었습니다. Preprint 서브미션에 대한 규칙, 책임감있는 빅데이터 연구를 위한 규칙 혹은 연구 소프트웨어를 더 강력하게 만드는 규칙 등 몇 가지 흥미로운 목록을 공유하고자 합니다.여기를 클릭하셔서 확인해보세요 >>앞서가는 QCI NGS는 변화하는 헬스케어의 정점에 있으며, 그 중 QIAGEN Clinical Insight™ (QCI)가 선도적인 역할을 하고 있습니다. 정밀의학의 다섯 가지 추세에 대해 알아보고 QCI가 각 도전과 기회를 다루는 방법에 대해 살펴보세요.여기를 클릭하셔서 더 알아보세요 >>InsightsHGMD and ANNOVAR summer releases HGMD Professional은 최근 4000개 이상 돌연변이가 추가되어 총 208,368개가 등록되어 있습니다. HGMD와 ANNOVAR에 대한 새로운 기능과 개선사항을 살펴보세요.여기를 클릭하셔서 더 알아보세요 >>Latest releasesBiomedical Genomics Workbench 4.1CLC Genomics Workbench 10.1 CLC Main Workbench 7.9 CLC Genomics Server 9.1 and CLC Command Line Tools 4.1 CLC Assembly Cell 5.0.4 HGMD® Professional 2017.2 ANNOVAR 2017.2 Genome Trax 2017.2
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[릴리즈] QIAGEN, The latest releases from QIAGEN Bioinformatics 조회 1295 The latest releases from QIAGEN BioinformaticsLatest releases : HGMD Professional, ANNOVAR and Genome TraxQIAGEN Bioinformatics의 최신 릴리즈를 확인해 주셔서 감사합니다. 여기에서 overview를 확인해보세요!HGMD ProfessionalHGMD Professional 여름 릴리즈에는 총 208,368 개의 돌연변이 항목이 포함됩니다. 이전 릴리즈에 비해서 4,483 개가 더 많습니다. 다른 돌연변이 데이터베이스와는 달리, HGMD 돌연변이는 모두 임상적 영향에 대해 증거가 있는 peer-reviewed 출판물에 등록된 것입니다.여기를 클릭하여 전체 HGMD 통계를 살펴보세요.ANNOVAR지난 마지막 릴리즈 발표 이후 ANNOVAR에서 다음과 같이 업데이트된 새로운 데이터베이스가 만들어져 제공됩니다.Table_annovar의 2017년 1월 버전에서는 유전자 기반 주석에 쉼표 대신 세미콜론이 사용되었습니다. 그러나 이것은 사용자 의견에 따라 변경이 다시 취소되었습니다.Gx 연산이 table_annovar에 추가되어 유전자에 대한 (ex : 유전자-질병 관계) 외부 참조 정보가 포함될 수 있습니다.완전한 아미노산 변화 정보 (ex: c.35delG:p.G12Vfs*2) 가 이제 table_annovar.pl과 coding_change.pl의 유전자 주석에 표시됩니다.Upstream 변이는 이제 UTR에서 전사 시작점 및 splice 변이까지의 거리를 보여주고 세부 정보를 표시합니다.복수의 주석 열이 있는 –xreffile이 구현되었습니다. 이 기능을 사용하시려면 코드를 다시 다운로드 하십시오.업데이트된 refGene, knownGene, ensGene 용어정의 및 hg18/hg19/hg38 coordinate의 FASTA 파일을 –webfrom annovar 인수와 함께 다운로드 할 수 있습니다. 이 때 사용자는 가장 최신버전만을 이용할 수 있습니다.COSMIC 81에서 noncoding 변이를 다루는 방법에 대한 지침이 업데이트 되었습니다.Genome Trax업데이트된 트랙은 HGMD와 관련되어 있어 동시에 릴리즈 되었습니다.업데이트된 추가 주요 트랙에는 TRANSFAC 2017.2, PROTEOME 2017.2가 포함됩니다.여기를 클릭하여 릴리즈 노트를 다운로드 받아보세요.
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[뉴스레터] QIAGEN, New tumor insights from past data - CLC Genomics Cloud Engine early access 조회 1259 Latest News이전의 데이터에서 새로운 tumor분석Xiong H. et al. 논문으로 개제된 이전 데이터를 Biomedical Genomics Workbench와 Ingenuity Pathway Analysis 어플리케이션을 이용하여 재분석하여 암의 진행에 관련 있을 것으로 밝혀졌습니다.>포스터 보러가기OmicsSoft 사용자 그룹미팅OmicsSoft는 수많은 사용자들이 생물정보와 유전체 연구를 가속화하도록 도와주었습니다. 사용자 그룹 미팅에서 지식을 공유하고, 동료들과 네트워크를 형성하고, 제품 개발에 영향을 줄 수 있는 기회를 가질 수 있습니다.>지금 등록하기 빠른 접속을 위한 등록QIAGEN은 지난 달 Bio IT World에서 새롭게 추가된 생물 정보학 포트폴리오 (CLC Genomics Cloud Engine)를 공개했습니다. QIAGEN의 엔터프라이즈급 클라우드 솔루션은 호평을 받았으며 다음달중 자세한 정보를 공개할 예정입니다.>클라우드 컴퓨팅의 장점 확인 NGS 속도의 향상Copenhagen 대학의 Genomic Medicine 센터에서 Finn Nielsen 박사 팀은 강력한 정밀 의학 솔루션 인 QIAGEN Clinical Insight를 사용하여 복잡한 임상 데이터를 분석하고 새로운 의학적 통찰력을 밝힙니다.>전체내용 확인하기 Insight Insight 분석 보틀넥을 제거 CLC Genomics Workbench는 NGS 데이터를 쉽게 분석하고 시각화 할 수 있는 플랫폼을 연구자들에게 제공합니다. 이 분석 도구가 과학 지식의 발전에 기여하는 방법을 보여주기 위해 문헌에서 최근 몇 가지 예를 모았습니다.>최근 인용논문 확인하기WebinarJune 14: Discovering high confidence variants from NGS using CLC Genomics Workbench - Part 2June 21: Statistical analysis, visualization and functional enrichment of RNA-seq data in CLC Genomics Workbench - Part 3June 28: Introduction to the CLC Genomics Cloud Engine – Enterprise NGS Made Easy (Europe)June 28: Introduction to the CLC Genomics Cloud Engine – Enterprise NGS Made Easy (U.S.)July 6: Bioinformatics for non-bioinformaticians in cancer clinical research July13: NGS: Now integrated and connected with your lab operations
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[뉴스레터] QIAGEN, OmicSoft Anniversary release - The future of genetic testing and precision medicine 조회 1341 안녕하세요! 이번 달에는 Medical Laboratory Observer (MLO)에 실린 기사 중 하나의 내용으로, QIAGEN의 CTO (Chief Technology Officer)인 Ramon Felciano가 유전자 검사와 정밀 의학의 미래 생물정보학에 대해 논의하려 합니다. 힘을 합치고 기술 향상 및 정책 변경을 추진하는 그의 대표 사례에 대해 자세히 읽어보십시오. 또한 QIAGEN은 OmicSoft의 특별한 기념일의 소프트웨어 릴리즈를 축하했습니다. 아래에서 모든 새로운 기능을 확인하세요.Latest newsOmicSoft 기념일 출시QIAGEN은 OmicSoft의 주력 소프트웨어 제품인 Array Suite 10.0의 10 주년 기념 출시를 발표하게 된 것을 기쁘게 생각합니다. 이 제품군은 OncoLand, DiseaseLand 및 GeneticsLand를 포함한 OmicSoft의 소프트웨어 및 데이터 서비스의 중추 역할을 합니다.발표자료를 확인해보세요 >>변화를 위한 집단 추진이제 의료계에 아주 거대한 변화의 조짐이 보입니다. Medical Lab Observer의 2017 년 4 월호에는 QIAGEN Bioinformatics의 CTO 인 Ramon Felciano 박사가 쓴 기사가 실렸습니다. Ramon Felciano는 전세계 환자들의 헬스케어를 크게 개선하기 위해 지역 사회가 노력할 수 있는 야심차고 현실적인 목표에 대해 논의합니다.기사를 읽어보세요 >> Insights문헌에서의 변이 분석희귀 질병 변이 발견에서부터 비대칭 유전학에 이르기까지 Ingenuity Variant Analysis는 과학적 발견의 많은 부분에 쓰입니다. QIAGEN은 연구자들이 이 툴을 사용하는 방법에 대해 읽는 것에 보람을 느끼며, 가장 최신 연구 자료를 모아봤습니다.출판물 검색을 참조해보세요 >>Webinars5월 7일 : Interpreting the results of your Phosphorproteomics Analysis in IPA - Part 36월 7일 : Introduction to CLC Genomics Workbench: A preview - Part 16월 14일 : Discovering high confidence variants from NGS using CLC Genomics Workbench - Part 26월 21일 : Statistical analysis, visualization and functional enrichment of RNA-seq data in CLC Genomics Workbench - Part 3QIAGEN TV 사이트에는 다양한 종류의 녹화된 웹세미나와 튜토리얼이 있습니다. 자세히 살펴보세요!Latest releasesOmicSoft Array Suite 10.0 Anniversary ReleaseHGMD 2017.1 Release
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[뉴스레터] QIAGEN, The Go-To for NGS Data Annotation - CLC Microbial Genomics Module 2.0 조회 1504 HGMD는 유전병을 일으키는 인간 유전자의 돌연변이 메커니즘에 대한 과학적 연구를 위해 1996년에 설립되어, 전세계의 연구자, 임상의, 진단 실험실 및 유전 상담가에게 필수 도구로 성장했습니다. HGMD가 얼마나 많이 성장해왔는지는 아래에 설명이 되어있습니다. 당신이 잘 알고 있듯이, 지금은 컨퍼런스 시즌입니다! 아래에 나열된 이벤트 중 어느 것이라도 참가하신다면 QIAGEN 부스나 테이블에 들려서 인사해주세요!Latest NewsNGS 데이터 주석에 필수HGMD의 20만 가지가 넘는 돌연변이 보고서와 pathogenicity 평가에 도움이 되는 개선 사항이, 카디프 대학교 (Cardiff University) 의대 의학유전학연구소의 연구팀에 의해 NGS 데이터 주석을 위한 도구로 확인 되었습니다. 또한 HGMD는 최근 “Human Gene Mutation Database : 의학연구, 유전 진단 및 차세대 시퀀싱 연구를 위한 유전변이 데이터의 포괄적인 보고를 향하여” 라는 제목의 인간 유전학 논문에서 다루어졌습니다.보고서를 확인해보세요>>보다 강력한 미생물 분석미생물 군집을 연구할 때 주요 질문 중 일부는 어떤 미생물이 존재하고 양이 얼마나 되는지 입니다. CLC Microbial Genomics Module 2.0을 사용하면 미생물 데이터에서 strain 레벨의 정확성을 갖고 미생물을 확인할 수 있습니다. 이 모듈은 Microbial Genomics Pro Suite의 일부로, whole genome 중심의 병원균 타이핑, 전염병 역학 분석 및 미생물 프로파일링에 필요한 모든 도구를 완벽하게 갖추고 있습니다.릴리즈 하이라이트를 확인해보세요>>InsightsIPA Spring Release의 새로운 기능은 무엇일까요?단백질 인산화 상태의 변화는 포유류 세포에서 중요한 조절 메커니즘을 제공합니다. 이제 새로운 인산화 코어 분석 (Phosphorylation Core Analysis)으로 IPA의 인산화 프로테오믹스 데이터 셋에서 upstream regulator와 causal network master regulator를 포함하여 더 많은 정보를 얻을 수 있습니다.주요 내용을 모두 읽어보세요 >> Webinars4월 12일 : Introduction to HGMD Professional 4월 17일 : Taxonomic Profiling using Shotgun Metagenomic Data4월 24일 : Understanding the Circulating Transcriptome with Advanced RNA-seq - Part 4강력한 지식 기반 IPA 소개 - 총 3 부의 웨비나 시리즈 5월 3일 : Introduction to IPA (Part 1)5월 10일 : Formatting and uploading your data into IPA (Part 2) 5월 17일 : Interpreting the results of your Phosphoproteomics Analysis in IPA (Part 3)QIAGEN TV 사이트에는 다양한 종류의 녹음된 웨비나와 튜토리얼이 있습니다. 클릭하여 살펴보세요.Events Molecular Diagnostics Europe Lisbon, Portugal - 4월 10-13일ECCMID 2017 Vienna, Austria - 4월 22-25일RNA-Seq 2017 San Fransisco, CA, U.S. - 4월 25-27일Immunology 2017 Washington D.C., U.S. - 5월 12-16일SFAF 2017 Santa Fe, U.S. - 5월 16-18일Bio-IT World 2017 Boston, U.S. - 5월 23-26일FEC 2017 Torshavn, Faroe Islands - 5월 24-26일ESHG 2017 Copenhagen, Denmark - 5월 27-30일Latest releasesIngenuity Pathway Analysis (IPA) - Spring 2017 ReleaseCLC Microbial Genomics Module 2.0
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