FAQ
게시판 리스트
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Input 데이터 개수에 따라 OTU report 결과가 다릅니다. 조회 1103 Input 파일을 하나만 넣었을 때와 여러 개를 넣었을 때 OTU report에 나오는 read 개수나 OTU개수가 다를 수 있습니다. OTU clustering workflow에 포함된 Fixed length trimming 기능 때문인데, input 데이터에 따라 자동으로 설정해주는 length가 다르기 때문입니다. 만약 몇 개의 샘플을 가지고 분석하던 상관없이 동일한 결과를 원하신다면 workflow를 실행 하실 때 Fixed length trimming 과정에서 옵션값을 auto로 지정하지 마시고 매뉴얼로 숫자를 입력해주시면 한 샘플을 넣어도 여러 샘플을 넣어도 같은 결과를 얻게 될 것입니다.
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원하는 reference genome 데이터가 없습니다. 조회 1400 1. 먼저 NCBI로 접속하셔서 Genome을 선택하신 다음 reference 서열을 원하는 종을 검색하여 주십시오.상단의 박스에 Download sequence에서 genome을 download genome annotation 에서는 GFF를 선택하여 다운로드 해주시기 바랍니다.2. 둘 다 압축을 풀지 않은 상태에서(압축을 풀어도 무관) Import아이콘을 클릭하여 Standard import 혹은 Fasta Read Files...를 선택하여 서열데이터를 import해줍니다. 경고메시지가 나온다면 No를 눌러주세요.3. Annotate with GFF file 툴을 이용하여 import한 서열데이터를 넣고 gff파일을 선택하여(압축여부 무관) 기존의 서열이 annotation을 입혀줍니다.3-1. Annotation with GFF file이 없다면 플러그인을 설치해야 합니다. OS가 윈도우라면 프로그램을 종료하고 CLC Genomics Workbench 아이콘을 선택한 다음 우클릭 하여 '관리자 권한으로 실행'으로 실행시켜 주시기 바랍니다.3-2. 우측 상단의 plugins 아이콘을 선택하여 뜨는 창에서 Download plugins를 눌러주세요.3-3 Annotate with GFF file이라는 플러그인을 찾아 'Download and Install' 버튼을 이용하여 설치해주시고 프로그램을 재실행해주시면 됩니다.
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C드라이브 용량 부족으로 다른 드라이브에 저장하고 싶습니다. 조회 1008 CLC Workbench는 기본적으로 C:\의 CLC_Data라는 폴더가 분석 결과파일을 저장하는 폴더의 default값으로 지정되어 있습니다.이를 변경하기 위해서는 먼저 Navigation Area의 두번째 아이콘인 'Add file location'기능을 이용하여 저장하고자 하는 폴더를 추가합니다. 이 때 추가하는 폴더는 다른 드라이브에 생성되어 있는 폴더여야만 다른 드라이브로 저장을 할 수 있습니다.그 다음 메뉴바의 Edit-Preferences로 들어가서 수정을 하시면 됩니다.Preference에 들어가시면 창이 뜨고, 왼쪽 탭에서 Advanced를 선택해주시면 아래와 같은 화면을 보실 수 있습니다.여기서 Default Data Location이라고 되어 있는 부분에 'Add file location'기능을 이용하여 추가하였던 폴더를 선택하시고 OK버튼을 눌러주시면 저장하는 default 폴더가 변경이 될 것입니다.
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알파벳 축약어/축약형에 대한 의미는 무엇인가요? 조회 1115 Mutation_typeD = deletionE = ampletG = grosdelI = insertionM = mutationN = grosinsP = complexR = prom,S = spliceX = indelCitation_typePrimary = primary literature reportAPR = additional phenotype reportFCR = functional characterization reportMCR = molecular characterization reportFAPR = report detailing both an additional phenotype and functional characterizationSAR = simple additional reportACR = additional case reportLSDB/LSDB report = refers to an entry linked out to the corresponding locus-specific database.Variant_typeDP = disease-associated polymorphisms. These are reported to be in significant association with disease (p<0.05) and are assumed to be functional (e.g. as a consequence of location, evolutionary conservation, replication studies etc), although there may be as yet no direct evidence (e.g. from an expression study) of function.DFP = disease-associated polymorphisms with additional supporting functional evidence. These are reported to be in significant association with disease (p<0.05) and to have evidence for being of direct functional importance (e.g. as a consequence of altered expression, mRNA studies etc).FP = in vitro/laboratory or in vivo functional polymorphisms. These are reported to affect the structure, function or expression of the gene (or gene product), but with no disease association reported as yet.DM = disease-causing mutations, pathological mutations reported to be disease causing in the original literature reportR = retired record. A record will be retired if it is deemed to no longer be disease causing
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데이터 백업방법을 알려주세요. 조회 966 만약 컴퓨터 이동(Reinstall) 진행 또는 데이터 공유를 위하여 데이터 백업을 해야하는 사항이라면, 총 두 가지(프로그램 내 Export/로컬) 방법으로 백업이 가능합니다.>> 데이터 백업하는 방법
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