기술 특징

GEO (Gene Expression Omnibus)는 NCBI에서 운영하는 대용량 유전자 발현 정보 데이터베이스입니다. 특정 실험 및 환경 조건에서 유전자 발현 프로 파일이 어떻게 변화하는지에 대한 종합적인 정보를 제공합니다. IncoDB GEO는 GEO 데이터를 로컬라이제이션하여, 자체 구축하고, 모듈처럼 활용하여 타 정보화 프로젝트에 통합되어 사용될 수 있도록 웹-데이터베이스 인터페이스를 제공합니다. GEO 식별번호를 이용하여, Platform, Series 정보를 자동 로컬 구축하고, 각종 검색기능을 제공합니다.

 

기술 소개

 

 

구현 환경

Python, Django, D3

 

포트폴리오

기관명 KIST
시스템명 Envi Pul-omics meta DB
개요 환경유해 관련 DNA array 실험결과를 데이터베이스화하고, 웹 인터페이스를 제공함. 유전자 기능 어노테이션에 IncoDB GEO 모듈이 사용됨